医用清洗器的MDR（Medical Device Regulation）CE认证办理流程如下：

1. 确定产品分类：根据MDR的要求，确定医用清洗器的产品分类和适用的附件。这将有助于确定适用的技术文件和评估要求。

2. 准备技术文件：收集和准备申请所需的技术文件，包括但不限于产品说明、技术规格、设计文件、性能测试报告、质量管理体系文件等。确保文件符合MDR的要求，并满足相关标准和指南。

3. 选择认证机构：选择合适的认证机构进行评估和认证。认证机构应为经过欧洲认可的第三方机构。

4. 进行技术文件评估：将技术文件提交给选择的认证机构进行评估。评估过程包括对文件的审查和验证，以确保文件符合MDR的要求。

5. 进行质量管理体系评估：如果适用，认证机构可能会对质量管理体系进行评估，以确保其符合MDR的要求。这可能涉及对质量手册、程序文件、培训记录等的审查。

6. 进行现场审核：认证机构可能会进行现场审核，以验证产品的设计、制造和质量管理体系的符合性。这可能包括对生产设施、工艺流程和相关记录的检查。

7. 编制CE技术文件和声明：在通过评估和审核后，认证机构将提供CE技术文件和CE声明。CE技术文件将成为您的产品在欧盟市场上合法销售的凭证。